MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis CV56 chromosome

Total Repeats: 45375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017486	T	7	7	441	447	0 %	100 %	0 %	0 %	385829590
2	NC_017486	TGTC	2	8	467	474	0 %	50 %	25 %	25 %	385829590
3	NC_017486	CTTG	2	8	495	502	0 %	50 %	25 %	25 %	385829590
4	NC_017486	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	385829590
5	NC_017486	ATT	2	6	521	526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829590
6	NC_017486	A	6	6	529	534	100 %	0 %	0 %	0 %	385829590
7	NC_017486	CGG	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829590
8	NC_017486	GAT	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829590
9	NC_017486	ATG	2	6	605	610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829590
10	NC_017486	AACTG	2	10	615	624	40 %	20 %	20 %	20 %	385829590
11	NC_017486	AATC	2	8	643	650	50 %	25 %	0 %	25 %	385829590
12	NC_017486	AGC	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829590
13	NC_017486	TTGCTG	2	12	779	790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385829590
14	NC_017486	TATT	2	8	818	825	25 %	75 %	0 %	0 %	385829590
15	NC_017486	TGG	2	6	828	833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385829590
16	NC_017486	ATGC	2	8	859	866	25 %	25 %	25 %	25 %	385829590
17	NC_017486	TGAC	2	8	884	891	25 %	25 %	25 %	25 %	385829590
18	NC_017486	TTC	2	6	918	923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829590
19	NC_017486	A	6	6	960	965	100 %	0 %	0 %	0 %	385829590
20	NC_017486	AAT	2	6	1141	1146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829590
21	NC_017486	ACT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829590
22	NC_017486	GATT	2	8	1299	1306	25 %	50 %	25 %	0 %	385829590
23	NC_017486	A	6	6	1416	1421	100 %	0 %	0 %	0 %	385829590
24	NC_017486	A	7	7	1456	1462	100 %	0 %	0 %	0 %	385829590
25	NC_017486	ATT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829590
26	NC_017486	TTG	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829590
27	NC_017486	GGC	2	6	1615	1620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385829590
28	NC_017486	CA	3	6	1627	1632	50 %	0 %	0 %	50 %	385829590
29	NC_017486	TAA	2	6	1899	1904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829591
30	NC_017486	TTGAAG	2	12	1988	1999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829591
31	NC_017486	TCAA	2	8	2038	2045	50 %	25 %	0 %	25 %	385829591
32	NC_017486	T	6	6	2049	2054	0 %	100 %	0 %	0 %	385829591
33	NC_017486	ATA	2	6	2063	2068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829591
34	NC_017486	GCT	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829591
35	NC_017486	AGA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
36	NC_017486	ATCA	2	8	2499	2506	50 %	25 %	0 %	25 %	385829591
37	NC_017486	ATG	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829591
38	NC_017486	AAG	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
39	NC_017486	TTA	2	6	2598	2603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829591
40	NC_017486	TTGA	2	8	2611	2618	25 %	50 %	25 %	0 %	385829591
41	NC_017486	TGC	2	6	2688	2693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829591
42	NC_017486	TTG	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829591
43	NC_017486	GTA	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829591
44	NC_017486	GAA	2	6	2824	2829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
45	NC_017486	AAG	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
46	NC_017486	TGAT	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	385829591
47	NC_017486	GAA	2	6	2977	2982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829591
48	NC_017486	GTAC	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	385829591
49	NC_017486	AATT	2	8	3019	3026	50 %	50 %	0 %	0 %	385829591
50	NC_017486	TA	3	6	3140	3145	50 %	50 %	0 %	0 %	385829592
51	NC_017486	GAA	2	6	3193	3198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
52	NC_017486	A	6	6	3204	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
53	NC_017486	TTA	2	6	3219	3224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
54	NC_017486	CTT	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
55	NC_017486	GAAA	2	8	3258	3265	75 %	0 %	25 %	0 %	385829592
56	NC_017486	GCA	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
57	NC_017486	TTA	2	6	3339	3344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
58	NC_017486	ACA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829592
59	NC_017486	CAG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
60	NC_017486	GAG	2	6	3423	3428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385829592
61	NC_017486	AGA	2	6	3438	3443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
62	NC_017486	CTG	2	6	3473	3478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
63	NC_017486	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	385829592
64	NC_017486	A	6	6	3573	3578	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
65	NC_017486	GAA	2	6	3595	3600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
66	NC_017486	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385829592
67	NC_017486	GTC	2	6	3650	3655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
68	NC_017486	GAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
69	NC_017486	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
70	NC_017486	ACA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385829592
71	NC_017486	AAAT	2	8	3986	3993	75 %	25 %	0 %	0 %	385829592
72	NC_017486	CTG	2	6	3995	4000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
73	NC_017486	A	6	6	4076	4081	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
74	NC_017486	T	6	6	4095	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	385829592
75	NC_017486	TAG	2	6	4118	4123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
76	NC_017486	GCT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385829592
77	NC_017486	GAAA	2	8	4152	4159	75 %	0 %	25 %	0 %	385829592
78	NC_017486	AAG	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
79	NC_017486	T	6	6	4231	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	385829592
80	NC_017486	A	8	8	4255	4262	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
81	NC_017486	GAT	2	6	4276	4281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
82	NC_017486	TCT	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
83	NC_017486	GAA	2	6	4330	4335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
84	NC_017486	A	7	7	4386	4392	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
85	NC_017486	A	6	6	4508	4513	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
86	NC_017486	A	7	7	4518	4524	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
87	NC_017486	T	6	6	4685	4690	0 %	100 %	0 %	0 %	385829592
88	NC_017486	TGA	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
89	NC_017486	TTA	2	6	4729	4734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
90	NC_017486	TGT	2	6	4782	4787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
91	NC_017486	TTG	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
92	NC_017486	TAA	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385829592
93	NC_017486	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	385829592
94	NC_017486	AATC	2	8	4917	4924	50 %	25 %	0 %	25 %	385829592
95	NC_017486	TGA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
96	NC_017486	TGT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
97	NC_017486	A	7	7	4976	4982	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
98	NC_017486	CTTT	2	8	4996	5003	0 %	75 %	0 %	25 %	385829592
99	NC_017486	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
100	NC_017486	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
101	NC_017486	TTC	2	6	5117	5122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
102	NC_017486	A	6	6	5123	5128	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
103	NC_017486	AAG	2	6	5132	5137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
104	NC_017486	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385829592
105	NC_017486	GAA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
106	NC_017486	A	7	7	5231	5237	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
107	NC_017486	TGA	2	6	5238	5243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
108	NC_017486	T	6	6	5252	5257	0 %	100 %	0 %	0 %	385829592
109	NC_017486	A	6	6	5303	5308	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
110	NC_017486	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
111	NC_017486	AAG	3	9	5540	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
112	NC_017486	TGA	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
113	NC_017486	ATG	2	6	5594	5599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
114	NC_017486	AGA	2	6	5664	5669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
115	NC_017486	AGAC	2	8	5677	5684	50 %	0 %	25 %	25 %	385829592
116	NC_017486	TGA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
117	NC_017486	AGT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
118	NC_017486	GAA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
119	NC_017486	TCT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385829592
120	NC_017486	ATT	2	6	5840	5845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385829592
121	NC_017486	AAG	2	6	5945	5950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
122	NC_017486	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
123	NC_017486	TTTA	2	8	5981	5988	25 %	75 %	0 %	0 %	385829592
124	NC_017486	ATCA	2	8	6022	6029	50 %	25 %	0 %	25 %	385829592
125	NC_017486	ATG	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385829592
126	NC_017486	A	7	7	6132	6138	100 %	0 %	0 %	0 %	385829592
127	NC_017486	AAG	2	6	6155	6160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385829592
128	NC_017486	AGC	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829592
129	NC_017486	TGAA	2	8	6182	6189	50 %	25 %	25 %	0 %	385829592
130	NC_017486	ATGA	2	8	6346	6353	50 %	25 %	25 %	0 %	385829592
131	NC_017486	AATTGA	2	12	6559	6570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385829593
132	NC_017486	A	7	7	6595	6601	100 %	0 %	0 %	0 %	385829593
133	NC_017486	GCA	2	6	6602	6607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385829593
134	NC_017486	A	7	7	6640	6646	100 %	0 %	0 %	0 %	385829593
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136	NC_017486	AG	3	6	6817	6822	50 %	0 %	50 %	0 %	385829593
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